Ferramentas & Pipelines

Como Cientista Biomédico atuando na interseção entre a biologia molecular e a ciência de dados, meu foco de desenvolvimento é a criação de fluxos de trabalho (workflows) escaláveis, reprodutíveis e de alta performance.

Utilizo principalmente Nextflow e Snakemake para orquestrar análises multi-ômicas e pipelines de genômica tumoral.

Genômica e Variant Calling

  • nf-nexus
    • Status: Em Desenvolvimento Ativo
    • Descrição: Um pipeline robusto desenvolvido em Nextflow, projetado especificamente para replicar e otimizar o workflow de variant calling do GDC TCGA. Focado no processamento de dados de câncer, permitindo chamadas de variantes somáticas com alta precisão e reprodutibilidade.
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Análise Multi-ômica e Epigenética

  • Pipelines ChIP-seq & WES
    • Descrição: Workflows automatizados utilizando Snakemake e Nextflow para a análise abrangente de dados de Exoma Completo (WES) e Imunoprecipitação da Cromatina seguida de Sequenciamento (ChIP-seq). Utilizados na investigação de dados TCGA-BRCA, incluindo metilação de DNA, copy number e mutações somáticas em câncer de mama.
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Soluções Corporativas (Genobit)

  • GAIA - Genobit Automated Intelligent Analysis
    • Descrição: Como fundador da Genobit, atuo na arquitetura do GAIA, nossa plataforma SaaS de soluções computacionais avançadas para dados biológicos. O portal integra análises complexas de bioinformática em uma interface acessível para pesquisadores e laboratórios clínicos.
    • 🌐 Acessar o Portal GAIA

Comunidade & Open Source

  • Nextflow Ambassador
    • Atuo oficialmente como Embaixador do Nextflow, auxiliando a comunidade de bioinformática do Brasil e do mundo a adotar boas práticas de reprodutibilidade em pesquisa genômica.
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